今天分享的是【智药局:2023年AI制药行业报告】 报告出品方:智药局
基于网络的可药靶性发现的原理是在知识图谱及其嵌入(GRE)模型上,评估和推断不同生物实体之间的相互作用,从而发现新的可药靶性蛋白。 随 着AlphaFold2 的 问世 ,越来 越 多的 蛋白 质结 构得 到 验证 ,现有 成熟的数据库包括PDB、SCOPe、CATH、AlphaFold、TTD等。除此之外,还有与其他分子相互的作用的信息等多种数据库,如蛋白质组数据库、蛋白质相互作用数据库、药物基因组学数据库、基因本体论数据库、药物及其治疗靶点的信息、药品数据库、药物-靶点关系数据库、药物不良反应数据库等。
基于知识图谱预测可药靶性识别的方法,可以整合多源异质的生物医药信息,并获取其中的内在关联,在蛋白质可药靶性的识别上占据十分重要的地位。如图2-7所示,为TriModel模型原理图,TriModel模型是一种基于知识图谱嵌入的药物-靶标预测方法
网络药理学是一门结合生物信息学、网络科学和药物学等学科的新兴交叉学科。它基于大规模数据和计算机技术,探究药物分子与生物体内靶点、通路、基因等分子间的相互作用网络,以及这些相互作用对于药物的药效、毒性、代谢等影响。如图2-8所示,将药物、靶标等内容抽象成一个复杂的生物分子网络,可以通过它们之间的相互作用关系来认识疾病发生和发展的生物学机制。
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